XP U47-600-1
Méthodes d'analyse en santé animale - PCR (réaction de polymérisation en chaîne) - Partie 1 : exigences et recommandations pour la mise en oeuvre de la PCR en santé animale
Le présent document s'inscrit dans un ensemble de normes de méthodes d'analyse en santé animale.Le document a pour objectif de décrire des exigences générales et des recommandations dans le domaine de la PCR en santé animale, tant pour les laboratoires d'analyses que pour les producteurs de réactifs et les fabricants de matériel.Il définit les exigences générales relatives : à l'assurance qualité (locaux, personnel, matériels,...) ; à la mise en application dans le laboratoire ; aux différentes phases de réalisation et d'interprétation des essais (telles que : traitement des échantillons, extraction, amplification, détection/quantification des acides nucléiques, prise en compte et interprétation des signaux, exploitation des traceurs,...).
Le présent document s'inscrit dans un ensemble de normes de méthodes d'analyse en santé animale. Le document a pour objectif de décrire des exigences générales et des recommandations dans le domaine de la PCR en santé animale, tant pour les laboratoires d'analyses que pour les producteurs de réactifs et les fabricants de matériel. Il définit les exigences générales relatives : à l'assurance qualité (locaux, personnel, matériels,...) ; à la mise en application dans le laboratoire ; aux différentes phases de réalisation et d'interprétation des essais (telles que : traitement des échantillons, extraction, amplification, détection/quantification des acides nucléiques, prise en compte et interprétation des signaux, exploitation des traceurs,...).
Le présent document a pour objectif de décrire des exigences générales et des recommandations dans le domaine de la PCR en santé animale, tant pour les laboratoires d'analyses que pour les producteurs de réactifs et les fabricants de matériel. Ce document définit les exigences générales relatives : - à l'assurance qualité (locaux, personnel, matériels, etc.) ; - à la mise en application dans le laboratoire ; - aux différentes phases de réalisation et d'interprétation des essais (telles que : traitement des échantillons, extraction, amplification, détection/quantification des acides nucléiques, prise en compte et interprétation des signaux, exploitation des traceurs, etc.).
- Introduction6
- Avertissement6
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1 Domaine d'application7
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2 Références normatives7
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3 Termes et définitions8
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4 Principe16
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5 Locaux16
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5.1 Généralités16
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5.2 Agencement des locaux16
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5.3 Maîtrise des flux et des circuits18
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5.4 Entretien des locaux18
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6 Personnel19
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7 Appareillage et équipement19
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7.1 Thermocycleurs19
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7.2 Centrifugeuses21
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7.3 Appareils pour électrophorèse en gel21
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7.4 Hottes à flux laminaire, postes de sécurité microbiologique et "enceintes non ventilées"22
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7.5 Micropipettes et automate de pipetage22
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7.6 Automates d'extraction22
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7.7 Équipements à température contrôlée (hors thermocycleurs)22
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7.8 Spectrophotomètres luminomètres et fluorimètres23
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8 Réactifs et consommables23
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8.1 Acceptation et gestion des réactifs et consommables23
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8.2 Contrôle et suivi des réactifs et consommables critiques23
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9 Prélèvements23
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9.1 Nature du prélèvement24
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9.2 Conditions de prélèvement24
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10 Mode opératoire24
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10.1 Échantillon pour laboratoire24
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10.2 Description des matrices utilisées24
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10.3 Préparation de la "série pour analyse"24
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10.4 Lecture des signaux et validation d'une analyse PCR30
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10.5 Modification des conditions opératoires30
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10.6 Maintien des critères de validation30
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11 Adoption de méthode30
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11.1 Préambule30
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11.2 Confirmation des performances de la PCR31
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11.3 Confirmation des performances de la méthode complète32
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12 Analyse et interprétation des "signaux" de PCR34
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12.1 Modalités générales34
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12.2 Modalités spécifiques34
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12.3 Exigences relatives à l'évaluation de l'incertitude sur le résultat de l'analyse36
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13 Expression des Résultats38
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13.1 PCR qualitative38
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13.2 PCR quantitative38
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13.3 Génotypage39
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14 Rapport d'analyse39
- Annexe A (informative) Exemples de prélèvements et de conditions de conservation utilisables en Biologie Moléculaire41
- Annexe B (informative) Exemple d'application du paragraphe 11.3.2 de la norme modalités d'adoption d'une méthode en l'absence de matériau de référence dosé et de mise en place d'une sentinelle42
- Annexe C (informative) Courbes d'amplification et courbes de dissociation44
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C.1 Courbes d'amplification44
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C.2 Courbes de dissociation47
- Annexe D (informative) Exemple de suivi des résultats numériques obtenus pour des matériaux de référence à l'aide de cartes de contrôle48
- Bibliographie49
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