NF ISO 11063

NF ISO 11063

avril 2012
Norme Annulée

Qualité du sol - Méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de sol

La présente Norme internationale spécifie une méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de sol en vue d'analyser la structure globale et l'abondance des communautés microbiennes du sol en utilisant des techniques de PCR. Cette méthode est principalement destinée aux sols agricoles et forestiers. Cette méthode peut ne pas être appropriée aux sols riches en matières organiques (par exemple sols de tourbières) ou aux sols très pollués par des polluants organiques ou des métaux lourds. L'extraction directe de l'ADN d'échantillons de sol fournit des informations précieuses sur l'abondance et la structure des communautés microbiennes qui sont des paramètres clés pour estimer la biodiversité des communautés microbiennes telluriques. Les approches moléculaires utilisant l'amplification PCR (amplification en chaîne par polymérisation) de l'ADN extrait du sol offrent des perspectives prometteuses et peuvent contribuer, dans un futur proche, au développement d'outils de routine permettant de surveiller la qualité de la composante microbienne des sols. L'utilisateur de la méthode doit savoir que, même si le sol soumis au mode opératoire d'extraction de l'ADN est soigneusement tamisé (mailles de 2 mm, mode opératoire décrit en 5.1), des résidus végétaux peuvent demeurer dans les échantillons de sol et de ce fait, l'extrait d'ADN prélevé du sol peut être contaminé par des traces d'ADN végétal.

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Informations générales

Collections

Normes nationales et documents normatifs nationaux

Date de publication

avril 2012

Nombre de pages

30 p.

Référence

NF ISO 11063

Codes ICS

13.080.30   Propriétés biologiques des sols

Indice de classement

X31-263

Numéro de tirage

1 - 29/03/2012

Parenté internationale

ISO 11063:2012
Résumé
Qualité du sol - Méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de sol

La présente Norme internationale spécifie une méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de

sol en vue d'analyser la structure globale et l'abondance des communautés microbiennes du sol en utilisant

des techniques de PCR. Cette méthode est principalement destinée aux sols agricoles et forestiers. Cette

méthode peut ne pas être appropriée aux sols riches en matières organiques (par exemple sols de tourbières)

ou aux sols très pollués par des polluants organiques ou des métaux lourds.

L'extraction directe de l'ADN d'échantillons de sol fournit des informations précieuses sur l'abondance et

la structure des communautés microbiennes qui sont des paramètres clés pour estimer la biodiversité des

communautés microbiennes telluriques. Les approches moléculaires utilisant l'amplification PCR (amplification

en chaîne par polymérisation) de l'ADN extrait du sol offrent des perspectives prometteuses et peuvent

contribuer, dans un futur proche, au développement d'outils de routine permettant de surveiller la qualité de la

composante microbienne des sols.

L'utilisateur de la méthode doit savoir que, même si le sol soumis au mode opératoire d'extraction de l'ADN

est soigneusement tamisé (mailles de 2 mm, mode opératoire décrit en 5.1), des résidus végétaux peuvent

demeurer dans les échantillons de sol et de ce fait, l'extrait d'ADN prélevé du sol peut être contaminé par des

traces d'ADN végétal.

Norme remplacée par (1)
NF EN ISO 11063
mai 2013
Norme Annulée
Qualité du sol - Méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de sol

<p>La présente Norme internationale spécifie une méthode pour extraire directement l'ADN d'échantillons de</p> <p>sol en vue d'analyser la structure globale et l'abondance des communautés microbiennes du sol en utilisant</p> <p>des techniques de PCR. Cette méthode est principalement destinée aux sols agricoles et forestiers. Cette</p> <p>méthode peut ne pas être appropriée aux sols riches en matières organiques (par exemple sols de tourbières)</p> <p>ou aux sols très pollués par des polluants organiques ou des métaux lourds.</p> <p>L'extraction directe de l'ADN d'échantillons de sol fournit des informations précieuses sur l'abondance et</p> <p>la structure des communautés microbiennes qui sont des paramètres clés pour estimer la biodiversité des</p> <p>communautés microbiennes telluriques. Les approches moléculaires utilisant l'amplification PCR (amplification</p> <p>en chaîne par polymérisation) de l'ADN extrait du sol offrent des perspectives prometteuses et peuvent</p> <p>contribuer, dans un futur proche, au développement d'outils de routine permettant de surveiller la qualité de la</p> <p>composante microbienne des sols.</p> <p>L'utilisateur de la méthode doit savoir que, même si le sol soumis au mode opératoire d'extraction de l'ADN</p> <p>est soigneusement tamisé (mailles de 2 mm, mode opératoire décrit en 5.1), des résidus végétaux peuvent</p> <p>demeurer dans les échantillons de sol et de ce fait, l'extrait d'ADN prélevé du sol peut être contaminé par des</p> <p>traces d'ADN végétal.</p>

Sommaire
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  • Avant-propos
    iv
  • Introduction
    v
  • 1 Domaine d'application
    1
  • 2 Références normatives
    1
  • 3 Termes et définitions
    1
  • 4 Principe
    1
  • 5 Matériel d'essai
    2
  • 5.1 Sol
    2
  • 5.2 Substances chimiques
    2
  • 5.3 Tampons et réactifs
    3
  • 6 Appareillage
    4
  • 7 Modes opératoires
    4
  • 7.1 Préparation des échantillons de sol
    4
  • 7.2 Lyse mécano-chimique
    4
  • 7.3 Précipitation des protéines
    4
  • 7.4 Précipitation et rinçage des acides nucléiques
    4
  • 7.5 Conservation des acides nucléiques
    4
  • 8 Estimation de la qualité et de la quantité d'ADN du sol
    5
  • 8.1 Qualité et pureté de l'ADN du sol
    5
  • 8.2 Quantité d'ADN du sol
    5
  • 9 Validation du mode opératoire d'extraction
    5
  • 10 Étude interlaboratoires internationale
    5
  • 11 Rapport d'essai
    5
  • Annexe A (informative) Étude interlaboratoires internationale pour évaluer le mode opératoire d'extraction de l'ADN du sol
    7
  • Bibliographie
    22
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